PharmGKB
מידע לרופאים ואנשי מקצוע
PharmGKB Strength of Evidence Scores
Level 1A Annotation for a variant-drug combination in a CPIC or medical society-endorsed PGx guideline or implemented at a PGRN site or in another major health system.
Level 1B Annotation for a variant-drug combination where the preponderance of evidence shows an association. The association must be replicated in more than one cohort with significant p-values, and preferably will have a strong effect size.
Level 2A Annotation for a variant-drug combination that qualifies for level 2B where the variant is within a VIP (Very Important Pharmacogene) as defined by PharmGKB. The variants in level 2A are in known pharmacogenes, so functional significance is more likely.
Level 2B Annotation for a variant-drug combination with moderate evidence of an association. The association must be replicated but there may be some studies that do not show statistical significance, and/or the effect size may be small.
Level 3 Annotation for a variant-drug combination based on a single significant (not yet replicated) study or annotation for a variant-drug combination evaluated in multiple studies but lacking clear evidence of an association.
Level 4 Annotation based on a case report, non-significant study or in vitro, molecular or functional assay evidence only.
For more information about clinical annotations and levels of evidence, please refer to Pharmacogenomics knowledge for personalized medicine. Clinical pharmacology and therapeutics. 2012. Whirl-Carrillo M, McDonagh E M, Hebert J M, Gong L, Sangkuhl K, Thorn C F, Altman R B, Klein. T E. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22992668
ציון חוזק (Level of evidence) על פי PharmGKB
Level 1A: היחס תרופה – שינוי פרמקוגנטי שאושר על ידי CPIC, או מיושם באתר PGRN (Pharmacogenomics Research Network) או במערכת בריאות מרכזית אחרת.
Level 1B: היחס תרופה-שינוי גנטי עם זיקה חזקה וישירה. מחקרים שהראו חזרתיות ביותר בקבוצת מדגם אחת עם ערכי p משמעותיים, עם גודל השפעה חזק.
Level 2A: היחס תרופה – שינוי גנטי כאשר השינוי הגנטי נמצאת בתוך VIP (פרמקוגן חשוב מאוד) כהגדרתו של PharmGKB. הווריאציות ברמה 2A הן בפרמקוגנים ידועים, ולכן סביר יותר שבעל משמעות תפקודית.
Level 2B: היחס תרופה – שינוי גנטי עם עדויות מתונות לקשר. העדויות חוזרות אך ייתכנו כמה מחקרים שאינם מראים מובהקות סטטיסטית ו/או גודל האפקט עשוי להיות קטן.
Level 3: היחס תרופה – שינוי גנטי מבוסס על מחקר משמעותי יחיד (טרם משוכפל) או יחס תרופה – שינוי גנטי שהוערך במספר מחקרים, אך חסר ראיות ברורות לקשר.
Level 4: יחס תרופה – שינוי גנטי על סמך דוח מקרה, מחקר לא משמעותי או עדויות מבחנה (in-vitro), מולקולריות או פונקציונליות בלבד.
לקבלת מידע נוסף אודות הסברים קליניים ו-LOE, עיין ב:
Pharmacogenomics knowledge for personalized medicine. Clinical pharmacology and therapeutics.
- Whirl-Carrillo M, McDonagh E M, Hebert J M, Gong L, Sangkuhl K, Thorn C F, Altman R B, Klein
אין במידע ו/או בתכנים המופיעים במאמר משום מתן עצה רפואית, חוות דעת מקצועית, תחליף להתייעצות עם מומחה או מתן אבחנה בנוגע לטיפול במצב רפואי מסויים. לשם קבלת ייעוץ אישי יש לפנות להתייעצות עם רופא בתחום המומחיות המתאים. מבלי לגרוע מכלליות האמור, כל הסתמכות על התכנים המופיעים במאמר ופעולה על פיהם נעשים על אחריותך הבלעדית והמלאה ולא תהיה לך כל תביעה ו/או טענה ו/או דרישה כנגד כותבי ומפרסמי המאמר או מי מטעמם, בגין נזקים הנובעים משימוש במידע הכלול במאמר זה.
